NMR Experiment |
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Experiment | Type | Sample Contents | Solvent | Ionic Strength | pH | Pressure | Temperature (K) | Spectrometer |
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1 | 2D 1H-1H NOESY | 1 mM preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Cyt preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Ade preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Gua preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Ura preQ1-RNA 36mer, 1 mM U-H5,3',4',5',5''-2H preQ1-RNA 36mer | 100% D2O | 50 | 6.3 | ambient | 300 | |
2 | 2D 1H-1H NOESY | 1 mM preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N] preQ1-RNA 36mer | 90% H2O/10% D2O | 50 | 6.3 | ambient | 300 | |
3 | 2D 1H-1H TOCSY | 1 mM preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Cyt preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Ade preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Gua preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Ura preQ1-RNA 36mer, 1 mM U-H5,3',4',5',5''-2H preQ1-RNA 36mer | 100% D2O | 50 | 6.3 | ambient | 300 | |
4 | 3D HCCH-TOCSY | 1 mM preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Cyt preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Ade preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Gua preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Ura preQ1-RNA 36mer, 1 mM U-H5,3',4',5',5''-2H preQ1-RNA 36mer | 100% D2O | 50 | 6.3 | ambient | 300 | |
5 | 2D DQF-COSY | 1 mM preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Cyt preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Ade preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Gua preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Ura preQ1-RNA 36mer, 1 mM U-H5,3',4',5',5''-2H preQ1-RNA 36mer | 100% D2O | 50 | 6.3 | ambient | 300 | |
6 | 2D 1H-13C HSQC | 1 mM preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Cyt preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Ade preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Gua preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N]-Ura preQ1-RNA 36mer, 1 mM U-H5,3',4',5',5''-2H preQ1-RNA 36mer | 100% D2O | 50 | 6.3 | ambient | 300 | |
7 | 2D 1H-15N COSY | 1 mM preQ1-RNA 36mer, 1 mM [U-13C; U-15N] preQ1-RNA 36mer | 90% H2O/10% D2O | 50 | 6.3 | ambient | 300 | |
8 | 2D 1H-13C HSQC | 0.7 mM [U-13C; U-15N] preQ1-RNA 36mer | 90% H2O/10% D2O, phage | 50 | 6.3 | ambient | 300 | |
9 | 2D 1H-15N HSQC | 0.7 mM [U-13C; U-15N] preQ1-RNA 36mer | 90% H2O/10% D2O, phage | 50 | 6.3 | ambient | 300 | |