1OXH

The crystal structure of beta-ketoacyl-[acyl carrier protein] synthase II from Streptococcus Pneumoniae, Triclinic form

Structural Biology Knowledgebase: 1OXH SBKB.org


Experimental Data Snapshot

  • Method: X-RAY DIFFRACTION
  • Resolution: 2.09 Å
  • R-Value Free: 0.235
  • R-Value Work: 0.208

wwPDB Validation Full Report


Literature

Macromolecules
Sequence Display for 1OXH

Classification: TRANSFERASE

Total Structure Weight: 184173.22

Macromolecule Entities
Molecule Chains Length Organism Details
Beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase A, B, C, D 430 Streptococcus pneumoniae EC#: 2.3.1.179 IUBMB
Gene Name(s): fabF fabF_1 fabF_2 fabF_3 A66_00403 ERS011502_01292 ERS013931_01498 ERS019163_01247 ERS019166_01754 ERS019260_00983 ERS019267_00512 ERS019271_00557 ERS019291_01182 ERS019302_01033 ERS019338_00029 ERS019375_01359 ERS019416_00323 ERS019420_01635 ERS019473_01054 ERS019499_00856 ERS019591_00772 ERS019595_01446 ERS019665_01091 ERS019673_00725 ERS019694_00480 ERS020087_01804 ERS020121_01252 ERS020135_01352 ERS020136_01725 ERS020136_01765 ERS020138_00753 ERS020140_00582 ERS020141_01760 ERS020142_00958 ERS020143_00432 ERS020145_01483 ERS020146_00888 ERS020148_01293 ERS020151_01218 ERS020155_01703 ERS020157_01867 ERS020158_00157 ERS020178_03557 ERS020194_01427 ERS020199_00827 ERS020280_00999 ERS020337_01612 ERS020464_00859 ERS020491_01207 ERS020496_00147 ERS020499_00892 ERS020500_00008 ERS020518_00658 ERS020520_00008 ERS020521_01042 ERS020522_00399 ERS020523_00373 ERS020523_00429 ERS020524_00137 ERS020525_00233 ERS020526_01612 ERS020526_05286 ERS020527_00261 ERS020528_00391 ERS020531_00897 ERS020532_00904 ERS020534_00295 ERS020534_00540 ERS020537_00693 ERS020539_01368 ERS020541_00898 ERS020644_00243 ERS020692_02634 ERS020697_00572 ERS020724_00202 ERS020726_00822 ERS020728_00985 ERS020747_01639 ERS020755_01937 ERS020762_01629 ERS020808_01957 ERS020822_03571 ERS020827_02253 ERS020845_01526 ERS020901_01556 ERS020910_01562 ERS020969_01311 ERS021047_01323 ERS021056_00476 ERS021218_01784 ERS021294_00127 ERS021300_00948 ERS021309_01132 ERS021353_00333 ERS021354_05057 ERS021355_00812 ERS021360_00907 ERS021374_00335 ERS021389_01351 ERS021431_01055 ERS021433_00834 ERS021449_01669 ERS021536_00731 ERS021548_00850 ERS021551_01322 ERS021560_00468 ERS021629_05049 ERS021634_05162 ERS021635_00758 ERS021656_01474 ERS021706_00570 ERS021718_01287 ERS021733_02212 ERS021752_01466 ERS021757_00772 ERS021858_01946 ERS021862_00799 ERS021879_00623 ERS021903_01412 ERS021907_00800 ERS021948_00425 ERS021977_00926 ERS022016_01939 ERS022038_01228 ERS022045_04522 ERS022051_00603 ERS022071_01727 ERS022077_00569 ERS022135_00824 ERS022148_01556 ERS022165_01302 ERS022179_01122 ERS022199_01103 ERS022246_01183 ERS022282_00708 ERS022309_01658 ERS022329_01816 ERS022356_01373 ERS022363_00144 ERS022373_01732 ERS022382_00703 ERS022391_01556 ERS022409_01781 ERS022414_00687 ERS022527_01119 ERS022599_01307 ERS022629_01641 ERS022641_00351 ERS036307_02159 ERS043844_00577 ERS043900_00487 ERS043901_00247 ERS043922_00511 ERS043947_00433 ERS043959_00481 ERS043980_00483 ERS043984_00404 ERS043989_00433 ERS044004_00443 ERS044017_02623 ERS044087_00470 ERS044129_02191 ERS044145_02202 ERS044164_00424 ERS068727_01761 ERS069276_01739 ERS069281_01779 ERS069315_00359 ERS069369_02072 ERS069380_01949 ERS069920_00150 ERS069939_02526 ERS069941_00185 ERS069979_00440 ERS070010_00435 ERS070013_00240 ERS070029_00506 ERS070031_00535 ERS070051_00501 ERS070055_00332 ERS070077_00488 ERS070103_00511 ERS070112_00325 ERS070114_00515 ERS070161_00142 ERS070176_00402 ERS077210_02034 ERS077235_02022 ERS077238_01969 ERS077244_01998 ERS077257_02050 ERS077274_02005 ERS077289_02027 ERS077296_01900 ERS095986_01410 ERS096019_01078 ERS096050_01359 ERS096101_00283 ERS096111_00959 ERS096116_01416 ERS096117_00145 ERS096118_01088 ERS232442_01004 ERS232471_01497 ERS232474_01568 ERS232499_01016 ERS232508_01070 ERS232512_00304 ERS232514_01000 ERS232524_01995 ERS232572_02770 ERS445053_00080 SpnNT_00398

Small Molecules
Ligands 1 Unique
ID Chains Name / Formula / InChI Key 2D Diagram 3D Interactions
MG
Query on MG

A, B, C, D MAGNESIUM ION
Mg
JLVVSXFLKOJNIY-UHFFFAOYSA-N
Ligand Explorer
 
Binding Pocket (JSmol)
 
Electron Density (JSmol)

Experimental Data & Validation

Experimental Data

  • Method: X-RAY DIFFRACTION
  • Resolution: 2.09 Å
  • R-Value Free: 0.235
  • R-Value Work: 0.208
  • Space Group: P 1
  • Electron Density Server: EDS EDS

Unit Cell:

Length (Å) Angle (°)
a = 61.52 α = 89.83
b = 71.65 β = 83.09
c = 96.10 γ = 69.15

Structure Validation

View Full Validation Report or Ramachandran Plots



Entry History

Deposition Data

  • Deposited Date: 2003-04-02
  • Released Date: 2003-04-22
  • Deposition author(s): Price, A.C., Rock, C.O., White, S.W.

Revision History

  • 2011-07-13
    Type: Version format compliance | Details: compliance with PDB Exchange Dictionary V4